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鐵路立體化因減少平交道，有助改善交通狀況，因此各地方政府也競相爭取。根據運研所最新研究報告，發現鐵路立體化後，會增加台鐵營運成本且效率反降低，因此也建議訂定量化篩選門檻。

台北市是台灣最早完成鐵路立體化城市，市區鐵路全部地下化，員林鐵路高架化、台中市鐵路高架化及高雄鐵路地下化第一階段也已營運，進行中的鐵路立體化工程為台南市鐵路地下化及嘉義市鐵路高架化，其中台南鐵路立體化延伸至善化地區計畫則是列入審議中的計畫。

根據交通部運輸研究所最新提出的「鐵路立體化建設對交通及都市發展之影響分析」報告，目前鐵路立體化的做法，在於消除平交道後，確實減少了台鐵事故，但車站及路線的營運維修成本卻增加，其中車站營運成本增加1.9至8.2倍。

運研所研究報告指出，鐵路立體化目的在改善周邊道路交通狀況並促進都市縫合發展，但鐵路立體化建設需投入大量經費，對其他建設將產生排擠效應，建議未來可朝建立評估指標的方向發展，訂定量化門檻，避免地方政府只為追求鐵路立體化，投入人力及資源辦理非必要性可行性研究計畫。

運研所建議，除目前審議辦法所規定有關財務方面的自償率指標外，參考日本做法，以3項指標訂定量化門檻，首先以人口數為評估社經發展指標，當都市人口達一定人數以上，才考量鐵路立體化，日本是以都市人口20萬為實施基本條件。

研究報告也指出，鐵路平交道的改善不是只有鐵路立體化才能達成，包括智慧型平交道設施、車站大平台、連通道、公路立體化等，都是可以思考的方向，應檢討相關的補助規定，例如檢討將改善平交道所需的陸橋及地下道納入生活圈道路補助範圍，並對智慧型平交道設施、車站大平台、公路立體化等設施，應縮短審議時程並提高補助比例。